在食管切除术中，将被切除的部位包括，一部分食管、胃的顶部及其附近的淋巴结。这些淋巴结能捕获在全身不停移动的细菌、病毒或其他有害物质，包括癌细胞或其他异常细胞。一般通过隔膜开口，即裂孔，上拉胃剩余部分，并接合至食管剩余部分。